Ako rýchlo sa môže koronavírus mutovať?

Nový koronavírus, podobne ako všetky ostatné vírusy, mutuje alebo prechádza malými zmenami v genóme. Nedávno publikovaná štúdia naznačovala, že nový koronavírus, SARS-CoV-2, už mutoval na jeden a jeden menej agresívny kmeň. Odborníci však nie sú presvedčení.

Vedci našli typ „L“, ktorý považovali za agresívnejší, v 70% vzoriek vírusu. Zistili tiež, že prevalencia tohto kmeňa sa znížila po začiatku januára. V súčasnosti sa častejšie vyskytuje typ staršieho typu „S“, pretože „ľudská intervencia“, napríklad karanténa, môže znížiť schopnosť šírenia typu „L“, píšu vedci.

Nathan Grubaugh, epidemiológ na Yale School of Public Health, ktorý sa nezúčastnil štúdie, uviedol, že závery autorov sú „čisté špekulácie“. Jednak povedané, mutácie, na ktoré autori štúdie odkazovali, boli neuveriteľne malé - na objednávku niekoľkých nukleotidov, základných stavebných blokov génov, povedal. (SARS-CoV-2 má dĺžku asi 30 000 nukleotidov).

Tieto malé zmeny pravdepodobne nebudú mať vôbec žiadny zásadný vplyv na fungovanie vírusu, takže by bolo „nepresné“ tvrdiť, že tieto rozdiely znamenajú rôzne kmene. Vedci sa okrem toho zaoberali iba 103 prípadmi. „Je to veľmi malá vzorka z celkovej populácie vírusov,“ povedal Grubaugh pre Live Science. Zistenie mutácií, ktoré vírus prešiel po celom svete, si vyžaduje „netriviálne množstvo úsilia a niekedy trvá roky, kým sa dokončí,“ uviedol.

Iní vedci súhlasia. Zistenie, že koronavírus mutuje na dva kmene, pričom kmeň L vedie k závažnejšiemu ochoreniu, je pravdepodobne štatistickým artefaktom, “napísal na Twitteri Richard Neher, biológ a fyzik na Bazilejskej univerzite vo Švajčiarsku. Tento štatistický efekt je pravdepodobne spôsobený skorým odobratím vzorky skupiny L vo Wu-chane, čo malo za následok "vyššiu zjavnú" úmrtnosť, píše.

Keď dôjde k prudko rastúcemu miestnemu ohnisku, vedci rýchlo vzorkujú vírusové genómy od pacientov, čo vedie k nadmernému zastúpeniu niektorých variantov vírusu, napísal Neher. Autori príspevku uznávajú, že údaje v ich štúdii sú „stále veľmi obmedzené“ a je potrebné, aby pokračovali s väčšími súbormi údajov, aby lepšie porozumeli vývoju vírusu.

"Nemali by sme sa báť"

Grubaugh, ktorý vedel, že takéto papiere by vyšli počas tohto ohniska, uverejnil 18. februára komentár v časopise Nature Microbiology s názvom „Nemali by sme sa báť, keď sa vírus počas vypuknutia choroby mutuje.“

Slovo mutácia „prirodzene vyvoláva obavy z neočakávaných a šialených zmien,“ napísal. „V skutočnosti sú mutácie prirodzenou súčasťou životného cyklu vírusu a zriedkavo dramaticky ovplyvňujú ohniská.“ RNA vírusy alebo vírusy, ktoré majú namiesto DNA DNA ako svoj hlavný genetický materiál RNA, vrátane SARS-CoV-2, neustále mutujú a nemajú mechanizmy na opravu týchto "chýb", ako napríklad ľudské bunky.

Ale väčšina z týchto mutácií negatívne ovplyvňuje vírus. Ak mutácie nie sú pre vírus prospešné, zvyčajne sa eliminujú prirodzeným výberom, mechanizmus evolúcie, ktorým organizmy lepšie prispôsobené svojmu prostrediu majú tendenciu prežiť. Ostatné mutácie prežijú a zabudujú sa do „priemerného“ genómu vírusu.

Grubaugh napísal, že viac génov kóduje znaky ako závažnosť vírusu alebo schopnosť prenosu na iných ľudí. Aby sa vírus stal závažnejším alebo ľahšie prenášal, museli by mutovať viaceré gény. Napriek vysokej miere mutácií medzi vírusmi všeobecne je neobvyklé nájsť vírusy, ktoré menia taký spôsob prenosu medzi ľuďmi v tak krátkom časovom meradle.

Čo to všetko znamená pre vývoj možnej vakcíny?

Tieto vírusy „sú stále také geneticky podobné, že tieto mutácie by nemali zmeniť novú vakcínu,“ uviedol Grubaugh. Je „nepravdepodobné, že by sa vývojári o to museli starať.“ Keď je však vakcína vypnutá, vírus sa na ňu mohol prispôsobiť a vyvinúť rezistenciu, uviedol, ale vzhľadom na to, že iné vírusy RNA - ako sú tie, ktoré spôsobujú osýpky, príušnice a žltú zimnicu - nevyvinuli rezistenciu na vakcíny, tento scenár je nepravdepodobné.

V skutočnosti tieto mutácie pomáhajú vedcom sledovať kroky vírusu, uviedol Grubaugh.

Napríklad skupina vedcov v Brazílii nedávno izolovala SARS-CoV-2 od dvoch pacientov, u ktorých sa potvrdilo, že majú COVID-19, a sekvenovali kompletné genómy oboch vzoriek vírusu. Zistili, že genómy sa navzájom nelíšia, ale tiež sa veľmi líšia od genómov vírusových vzoriek, ktoré sa sekvencovali v čínskom meste Wuhan. Vedci napísali správu, ktorá nebola recenzovaná, ale uverejnená na fóre. 28. februára.

Koronavírus odobratý od jedného pacienta v Brazílii mal genóm podobný vírusu, ktorý sa sekvenoval v Nemecku, a vírus od druhého pacienta sa podobal vírusu koronavírusu v Spojenom kráľovstve. To znamená, že títo dvaja pacienti sú spojení s prípadmi v Európe, ale nie navzájom.